宗教團體在高雄市辦理設立登記共有三種管道：
一、依辦理寺廟登記須知設立之寺廟。
二、依人民團體法設立之宗教類社團法人。
三、依民法及高雄市政府審查宗教業務財團法人設立許可及監督要點設立之財團法人。
其中第一類及第三類在本局辦理，其相關流程及表件如下：
第三類：宗教財團法人設立登記
財團法人申請設立作業流程圖
